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北大团队及合作者发现新冠病毒存在两个主要谱

近日,由中国科学院主理的英文综合性期刊《国家科学评论》颁发了由北京大年夜门生命科学学院陆剑课题组和中国科学院上海巴斯德钻研所崔杰课题组相助撰写的论文《SARS-CoV-2的起源与持续进化》,对新冠病毒基因组的演化动态进行深入钻研和解读。该钻研最早提出了新冠病毒存在两个主要谱系,从基因组水平上加深了我们对这种新型病毒的熟识,对新冠肺炎疫情的临床诊断具有紧张参考代价。

陆剑其课题组在基因组和分子演化领域履历富厚,并有一系列紧张钻研成果,尤为长于从RNA水平上钻研基因表达调控的机制和进化规律。陆剑回忆:“我是从1月下旬开始经由过程新闻关注到了此次疫情的成长。”跟着疫情日益严重,陆剑深感该当运用实验室的特长,使用进化生物学的措施来对病毒的基因组序列进行阐发和解读,开展病毒基因组的演化钻研,为抗“疫”作出供献。“只有懂得病毒,才能更好地找到快速诊断、缜密防御和有效治疗病毒感染的步伐,”陆剑说,“开展这项钻研也是在抗‘疫’时代我考试测验的教授教化革新,以培养门生分子进化和基因组学方面的阐发能力。”

之后,陆剑课题组与崔杰课题组相助,经由过程对新冠病毒和近缘病毒进行系统发生阐发,发明新冠病毒虽然与蝙蝠冠状病毒RaTG13的基因组总体差异较小,但其基因组内中性进化位点的差异高达17%,注解新冠病毒在进化历程中经历了异常强的自然选择。经由过程对新冠病毒和来自马来穿山甲的冠状病毒的核苷酸对照,推想新冠病毒与其不同事故并非近期发生,也阐明新冠病毒的起源可能更为繁杂。

两个课题组经由过程对当时公共数据库中仅有的103个新冠病毒基因组全序列进行分子演化系统阐发,首次发明依据两个高度连锁的突变位点,分手位于参考基因组的第8782和28144位,可以把新冠病毒主要分为“L”和“S”两个谱系,因基因组28144位突变对应的氨基酸分手是亮氨酸(L)和丝氨酸(S)而得名。在103个新冠病毒样品中,72个为“L”谱系,29个为“S”谱系;在别的2个样品中,1例可能是L和S谱系的混杂体,而另1例因为发生了突变而不属于这两个谱系。虽然“L”谱系比“S”谱系更为普遍,然则进一步阐发注解,“S”谱系更靠近在蝙蝠和穿山甲体内发明的病毒,提示“S”更为古老。他们的数据阐发回注解,新冠病毒的L和S两个谱系不是新近因为碱基发生变更而孕育发生的,而是在病毒爆发的早期可能就已经存在了。陆剑先容,“我们的钻研从分子演化的角度加深了对新冠病毒的熟识。”

论文颁发后迅速引起了国内外学界和媒体的热切关注,激发了多个学术论坛针对相关机制展开的深入探究,《科学》等学术期刊和国内外多家新闻媒体纷繁予以报道。据《国家科学评论》官方网站数据显示,论文颁发至今涉猎量已经排在了该杂志所有文章涉猎量的榜首,被下载8.8万多次。

陆剑表示,之前的钻研是根据当时103个新冠病毒基因组全序列进行分子演化系统阐发,得出了初步的阶段性结果,下一步还要连点成线,并结合临床数据和盛行病学结果开展深入钻研。今朝,课题组正在深入钻研新冠病毒序列在世界范围内的变更趋势,并与广州医科大年夜学、武汉大年夜学相关团队展开相助,将进化阐发与临床数据相结合,做进一步的钻研。

滥觞:北京日报

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